Проблемы сбора и долгосрочного сохранения электронной информации носят правовой, организационный, технологический, кадровый, финансово-экономический характер.
Для того чтобы обеспечить правомерность действий, необходимых для создания, использования, защиты и долговременного сохранения цифровых материалов, необходим пересмотр и гармонизация законодательства об обязательном экземпляре документов, о защите информации, об охране прав на интеллектуальную собственность и библиотечное, музейное, архивное законодательство.
Организационные проблемы состоят в неопределенности статуса электронных информационных ресурсов; отсутствии разделения ответственности за сбор и долговременное сохранение электронной информации между библиотеками, музеями, архивами, различными ведомствами и уровнями административного подчинения; нерешенностью вопросов отбора и учета электронных документов; отсутствием инфраструктуры сбора, оперативного и долговременного сохранения.
Технологические проблемы сводятся к отсутствию технологий и методик сохранения электронной информации в библиотеках, музеях, архивах, которые. страдают от недостаточности или отсутствия методических материалов, техники, технологий, помещений, необходимых для защиты и сохранения электронных информационных ресурсов. Вопросы стандартов и метаданных, связанных с сохранением информации, также не решены.
Решение задач сбора, защиты и долговременного сохранения электронной информации осложняется кадровыми проблемами. Прежде всего, учреждения культуры должны иметь в своем штате ИТ- специалистов высокой квалификации, поскольку процессы сохранения электронной информации базируются на современных информационных технологиях. Большинство федеральных и региональных библиотек, федеральных музеев и архивов к настоящему времени уже обеспечены квалифицированными технологами, но для менее крупных учреждений культуры этот вопрос остается достаточно острым, т.к. у них недостаточно финансовых средств для привлечения специалистов соответствующей квалификации.

Но нельзя считать, что обеспечение оперативного и долговременного сохранения электронной информации можно полностью переложить на плечи ИТ-специалистов. Каждый сотрудник современного учреждения культуры должен обладать принципиально новыми знаниями, умениями и навыками, адекватными вызовам информационного общества, в том числе решению сиюминутных и общих задач по сохранению электронной информации.

Сохранение электронной информации стоит значительно дороже, чем сохранение традиционных фондов. Оно не может быть окончательным результатом реализации какого-то проекта или ряда проектов, но должно стать регулярным, постоянным и обязательным процессом в любом учреждении, создающем собственные цифровые информационные ресурсы.
Планирование, в том числе финансово-экономическое, процессов сохранения электронной информации необходимо на начальной стадии реализации любого проекта, подразумевающего сбор, комплектование или создание электронных информационных ресурсов.

Необходимы системные целенаправленные действия по сохранению той электронной информации, которая уже накапливается библиотеками, музеями, архивами и той, которая пока еще по разным причинам остается за пределами их внимания. Системная деятельность по сохранению электронных информационных ресурсов в общероссийском масштабе значительно экономичнее и эффективнее, чем отдельные мероприятия.
Такая деятельность может осуществляться только в рамках специальной программы.